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纪70年代末80年代初的水平上。第二，地理标志保护的农产品的产业集群一般都是在劳动密集型的低成本优势的基础上创立的，所以单个小企业不可能有自己的研究与开发机构。第三，农户的专业知识技术水平更是很难满足在农业生产过程中的需求，更难以在农业生产管理过程中快速创新以适应市场对产品的需求。第四，缺乏生产要素流转市场和管理机构。农村可以成为丰富的原材料生产基地，可以提供廉价的劳动力，可以寻求建立销售市场和中介组织，但是，对于科学技术、资金等生产要素，农村地区是难以自我满足的，必须通过政府组建相关机构吸引投资和项目招标等促进生产要素向农村地区流动。因此，我国地理标志农产品科技含量低，农业产业集群的区域创新能力较低，这不利于制定和提高地理标志产品的生产标准和促进产业升级优化。
3.不注重培育地理标志产品生产的龙头企业。龙头企业的牵动能力直接决定着以地理标志为基础的特色农业产业集群发展的规模和成效，是实施特色农业产业集群发展的要求。目前，我国从事地理标志农业生产经营的企业在发展速度、规模和效益水平等方面都还比较低，市场竞争能力弱，没有形成一批龙头企业来带动特色农业产业集群的发展。而且地理标志可以为很多家企业使用，有些企业不注重自身实力的培育、自身资源的整合，目光短浅，不注重自身长远战略的规划，只看当前获得的收益。
4.我国农村的很多集群产业是集而不群，只是扎堆，简单的重复生产，无法进一步挖掘农产品地理标志的潜在价值。区域创新能力低不利于内部产业集群的发展，还可能造成集群产业只是简单的重复生产或低水平发展，产业链上环节少且各环节发展不协调，相关辅助性机构严重缺位，甚至变成孤立的生产环节，因此无法挖掘农产品地理标志的潜在价值。高水平的集群最显著的一个特征是发达的社会网络关系，因为产业集群是由交易网络、技术网络与社会网络交织所形成的网络结构，这种网络结构不仅能降低交易成本，而且能促进协作，形成协同效应。协同强调双方或多方相互配合、密切合作、共同完成某项任务。而目前与地理标志保护农产品的产业集群相关联的支持性和辅助性机构的各主体畸形成长，难以融为一体，导致我国农村很多低水平的集群产业中各经济主体之间的联系松散，信息交流少，生产结构趋同。
5.在农业产业集群发展过程中不注重对区域地理标志主体的培养和建设。农业产业集群中最为常见的中介组织是产销协会，但是现在的产销协会几乎都是小而全的“全职保姆”组织，技术、农民培训、科研、营销服务等一应俱全，但真正需要建立地理标志品牌的时候只能通过政府或其他机构获取资金和政策上的帮助。另外，在地理标志品牌建设过程中往往出现“多头领导”的局面：一方面，技术和资金的支持来源困难使得区域内各利益主体形成弱合作，对地理标志品牌缺乏科学的管理；另一方面，避害趋利的心态使得产业集群中缺乏权威的组织机构监督地理标志的使用。这种管理体制使得一些农户的劣质产品破坏r地理标志的形象，而且这种生产标准准人方法很难瞄准真正的优质生产者和剔除劣质生产者。
四、基于产业集群的保护和发展农产品地理标志的措施
保护农产品地理标志的过程也是农产品地理标志从比较优势转化为竞争优势的过程，而这个过程强调的是通过这种转化，经过资源整合，地理标志获得更长久生命力的过程，从这个意义上来说，保护与发展地理标志实际上也就是保护与地理标志相关的农业产业或农产品。因此对实施地理标志的农业产业进行保护，可以促使我国加快把主要依靠生产要素数量和低成本的比较优势增长模式逐步转向主要依靠核心竞争能力提升的发展模式上来。具体来说，基于产业集群理论的农产品地理标志保护的措施包括：
1.因地制宜培育特色农业产业。发展地理标志农产品就要因地制宜，比选出具有地域性优势的特色农产品加以重点发展，构筑实施地理标志的特色主导产业。同时，要大力发展地理标志农产品加工业，提高农产品加工的技术水平，形成具有地方特色的农产品加工体系，变资源优势为商品优势，迅速形成优势的特色产业。
2.提升农业产业集群的生产要素条件。生产要素可以分为初级资源要素和高级资源要素。目前地理标志涉及到的主要是自然资源、历史、传统人文等初级要素，这些要素是自然生成的，只要简单的私人及社会投资就能拥有。而对于知识、技术、资本等高级资源要素则需要依靠持续地追加投资创造出来，因此，保护与发展农产品地理标志使拥有农产品地理标志的产业由比较优势转化为竞争优势：第一，需要对实施农产品地理标志保护的产业加大知识、技术等投入，促使农业产业由劳动密集型向资本和技术密集型发展。第二，加强制度创新和科技创新，提升农业综合生产能力，以支持地理标志农产品产业的持续竞争力。第三，要大力提高地理标志农产品品质，积极推进发展无公害食品、绿色食品和有机食品生产，
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